Pusat Penelitian Informatika - LIPI telah mengadakan kerjasama dengan berbagai instansi, meliputi :

1. Sun Microsystem - Java Competency Center
2. Kementrian Negara Riset dan Teknologi - IGOS Desktop
3. Departemen Komunikasi dan Informasi
4. PT INTI
5. PT PLN
   
6. PT TELKOM
7. TNI - Angkatan Laut
8. Penelitian di Lingkungan LIPI, PTN dan PTS